MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 67131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021824	TC	3	6	7	12	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021824	TC	3	6	27	32	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021824	TAC	2	6	67	72	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021824	TTCC	2	8	126	133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021824	CACT	2	8	180	187	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021824	TGT	2	6	279	284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021824	CGCCTA	2	12	289	300	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021824	CTT	2	6	387	392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021824	CCA	2	6	429	434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021824	TGG	2	6	584	589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021824	AT	3	6	648	653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021824	TGG	2	6	668	673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021824	GA	3	6	848	853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021824	CGTG	2	8	919	926	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021824	AGTA	2	8	940	947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021824	TTACC	2	10	948	957	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_021824	CAA	2	6	1067	1072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021824	ACT	2	6	1131	1136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021824	TCC	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021824	CCG	2	6	1284	1289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021824	CTTT	2	8	1379	1386	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021824	AAG	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021824	CTT	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021824	TCGC	2	8	1453	1460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021824	TCC	2	6	1492	1497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021824	CTT	2	6	1656	1661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021824	GTT	2	6	1732	1737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021824	GAT	2	6	1759	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021824	GAT	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021824	TGG	2	6	1882	1887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021824	CCT	2	6	1912	1917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021824	ATT	2	6	1971	1976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021824	AGAA	2	8	1992	1999	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021824	AG	3	6	2140	2145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021824	AGA	2	6	2171	2176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021824	TTTCCT	2	12	2192	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021824	AGG	2	6	2209	2214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021824	CGG	2	6	2282	2287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021824	GTG	2	6	2336	2341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021824	GT	3	6	2351	2356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021824	GT	3	6	2520	2525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021824	ATG	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021824	TCC	2	6	2571	2576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021824	CACGA	2	10	2669	2678	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_021824	GAC	2	6	2682	2687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021824	CAC	2	6	2695	2700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021824	TTC	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021824	GCA	2	6	2889	2894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021824	AG	3	6	3009	3014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021824	TCC	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021824	CTC	2	6	3080	3085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021824	GC	4	8	3167	3174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021824	GCT	2	6	3224	3229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021824	TTC	2	6	3297	3302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021824	AAC	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021824	CTT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021824	GCG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021824	CTG	2	6	3392	3397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021824	CAGG	2	8	3620	3627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021824	TCC	2	6	3680	3685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021824	GTTC	2	8	3686	3693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021824	CGC	2	6	3713	3718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021824	CT	3	6	3746	3751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021824	TTGAAT	2	12	3764	3775	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021824	AATTA	2	10	3828	3837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021824	GTTT	2	8	3841	3848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021824	TCT	3	9	3917	3925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021824	TTG	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021824	T	6	6	4037	4042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021824	A	6	6	4054	4059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021824	TGT	2	6	4110	4115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869763
72	NC_021824	TTC	2	6	4134	4139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869763
73	NC_021824	ATA	2	6	4180	4185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869763
74	NC_021824	TTG	2	6	4284	4289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869763
75	NC_021824	TCG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869763
76	NC_021824	GTT	3	9	4555	4563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869763
77	NC_021824	GCT	2	6	4606	4611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869763
78	NC_021824	GTT	2	6	4625	4630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869763
79	NC_021824	TTC	2	6	4632	4637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869763
80	NC_021824	CTTCG	2	10	4646	4655	0 %	40 %	20 %	40 %	525869763
81	NC_021824	T	6	6	4656	4661	0 %	100 %	0 %	0 %	525869763
82	NC_021824	ACT	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869763
83	NC_021824	TCT	2	6	4687	4692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869763
84	NC_021824	CCG	2	6	4702	4707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525869763
85	NC_021824	GATA	2	8	4854	4861	50 %	25 %	25 %	0 %	525869763
86	NC_021824	CTT	2	6	4865	4870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869763
87	NC_021824	CCT	2	6	4873	4878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021824	GAA	2	6	4907	4912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021824	CAAA	3	12	4918	4929	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021824	A	6	6	4927	4932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021824	T	6	6	5000	5005	0 %	100 %	0 %	0 %	525869764
92	NC_021824	TGGT	2	8	5066	5073	0 %	50 %	50 %	0 %	525869764
93	NC_021824	AAG	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869764
94	NC_021824	ACA	2	6	5175	5180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869764
95	NC_021824	CTT	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869764
96	NC_021824	ACG	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869764
97	NC_021824	AT	3	6	5373	5378	50 %	50 %	0 %	0 %	525869764
98	NC_021824	T	6	6	5432	5437	0 %	100 %	0 %	0 %	525869764
99	NC_021824	AAT	2	6	5460	5465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869764
100	NC_021824	CCA	2	6	5471	5476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869764
101	NC_021824	GCT	2	6	5556	5561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869764
102	NC_021824	T	6	6	5583	5588	0 %	100 %	0 %	0 %	525869764
103	NC_021824	TGCT	2	8	5611	5618	0 %	50 %	25 %	25 %	525869764
104	NC_021824	GCT	4	12	5616	5627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869764
105	NC_021824	AAC	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869764
106	NC_021824	GC	3	6	5767	5772	0 %	0 %	50 %	50 %	525869764
107	NC_021824	T	6	6	5804	5809	0 %	100 %	0 %	0 %	525869764
108	NC_021824	CTT	2	6	5815	5820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869764
109	NC_021824	T	6	6	5828	5833	0 %	100 %	0 %	0 %	525869764
110	NC_021824	TGT	3	9	5876	5884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869764
111	NC_021824	ACT	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869764
112	NC_021824	GTAA	2	8	5947	5954	50 %	25 %	25 %	0 %	525869764
113	NC_021824	GCA	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869764
114	NC_021824	ACC	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869764
115	NC_021824	T	6	6	6118	6123	0 %	100 %	0 %	0 %	525869764
116	NC_021824	T	6	6	6131	6136	0 %	100 %	0 %	0 %	525869764
117	NC_021824	TTC	2	6	6149	6154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869764
118	NC_021824	CCAA	2	8	6182	6189	50 %	0 %	0 %	50 %	525869764
119	NC_021824	CAT	2	6	6193	6198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869764
120	NC_021824	GCT	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869764
121	NC_021824	CTG	2	6	6244	6249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869764
122	NC_021824	TTC	2	6	6272	6277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869764
123	NC_021824	A	7	7	6278	6284	100 %	0 %	0 %	0 %	525869764
124	NC_021824	AAT	2	6	6298	6303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869764
125	NC_021824	A	6	6	6342	6347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021824	TTA	2	6	6354	6359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021824	ATCA	2	8	6367	6374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021824	CTT	2	6	6455	6460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869765
129	NC_021824	TAA	2	6	6493	6498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869765
130	NC_021824	ATC	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869765
131	NC_021824	TCA	2	6	6545	6550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869765
132	NC_021824	AAG	2	6	6559	6564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869765
133	NC_021824	TTGC	2	8	6686	6693	0 %	50 %	25 %	25 %	525869765
134	NC_021824	CTT	2	6	6699	6704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869765
135	NC_021824	GTTTG	2	10	6710	6719	0 %	60 %	40 %	0 %	525869765
136	NC_021824	TC	3	6	6761	6766	0 %	50 %	0 %	50 %	525869765
137	NC_021824	TCTT	2	8	6782	6789	0 %	75 %	0 %	25 %	525869765
138	NC_021824	TA	3	6	6795	6800	50 %	50 %	0 %	0 %	525869765
139	NC_021824	AATA	2	8	6865	6872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021824	TAC	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021824	T	6	6	6991	6996	0 %	100 %	0 %	0 %	525869766
142	NC_021824	TTC	2	6	7003	7008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869766
143	NC_021824	TCG	2	6	7037	7042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869766
144	NC_021824	GTTG	2	8	7073	7080	0 %	50 %	50 %	0 %	525869766
145	NC_021824	ATTTT	2	10	7121	7130	20 %	80 %	0 %	0 %	525869766
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410	NC_021824	ATG	2	6	17833	17838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869774
411	NC_021824	AGT	2	6	17861	17866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869775
412	NC_021824	ATT	2	6	17874	17879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869775
413	NC_021824	TGG	2	6	17924	17929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525869775
414	NC_021824	ACT	2	6	17975	17980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869775
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417	NC_021824	GTT	2	6	18192	18197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869775
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425	NC_021824	GGC	2	6	18776	18781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525869777
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427	NC_021824	ACG	2	6	18834	18839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869777
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429	NC_021824	TAT	2	6	18909	18914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869777
430	NC_021824	TTG	2	6	18934	18939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869777
431	NC_021824	TAC	2	6	19018	19023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869777
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435	NC_021824	GAT	2	6	19130	19135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869777
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440	NC_021824	AC	3	6	19369	19374	50 %	0 %	0 %	50 %	525869777
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443	NC_021824	ATT	2	6	19593	19598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869777
444	NC_021824	A	7	7	19658	19664	100 %	0 %	0 %	0 %	525869777
445	NC_021824	TGA	2	6	19675	19680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869777
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450	NC_021824	A	6	6	19890	19895	100 %	0 %	0 %	0 %	525869777
451	NC_021824	A	7	7	19923	19929	100 %	0 %	0 %	0 %	525869777
452	NC_021824	AGT	2	6	19940	19945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869777
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455	NC_021824	TAATA	2	10	20096	20105	60 %	40 %	0 %	0 %	525869778
456	NC_021824	CTTG	2	8	20106	20113	0 %	50 %	25 %	25 %	525869778
457	NC_021824	TCA	2	6	20133	20138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869778
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460	NC_021824	ACG	2	6	20358	20363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869778
461	NC_021824	ACT	2	6	20396	20401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869778
462	NC_021824	GAT	2	6	20442	20447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869778
463	NC_021824	GAA	3	9	20490	20498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869778
464	NC_021824	CAA	2	6	20503	20508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869778
465	NC_021824	GAT	2	6	20551	20556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869778
466	NC_021824	ACT	2	6	20639	20644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869779
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470	NC_021824	ATT	3	9	20841	20849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869780
471	NC_021824	TAT	2	6	20852	20857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869780
472	NC_021824	GGT	2	6	20868	20873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525869780
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483	NC_021824	GAATG	2	10	21244	21253	40 %	20 %	40 %	0 %	525869780
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492	NC_021824	TCA	2	6	21435	21440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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499	NC_021824	AAC	2	6	21770	21775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869781
500	NC_021824	CTT	2	6	21840	21845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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